Bertolak dari RPJM kota Ambon tahun 2011 – 2016 Kondisi objektif yang ada, didapati sejumlah permasalahan kehutanan pertanian dan peternakan baik secara internal maupun eksternal sebagai berikut :

Pertanian

  1. Pada daerah – daerah tertentu masih kekurangan air dan ketersediaan akses jalan sehingga menghambat proses produksi
  2. Kurangnya pengawasan dan pengendalian terhadap penggunaan pupuk dan pestisida yang berdampak bagi kesehatan
  3. Kemampuan teknis dan manajemen dari petani pengelola masih rendah
  4. Terbatasnya sarana dan prasarana penunjang operasional
  5. Masih minimnya penggunaan Benih/bibit bermutu dan bersertifikasi
  6. Produksi dan produktifitas komoditas pertanian masih rendah
  7. Keterbatasan akses petani terhadap permodalan

Peternakan

  1. Ambon belum bebas  penyakit  ternak menular
  2. Tingginya pemotongan betina produktif pada Rumah Potong Hewan (RPH)
  3. Produksi dan produktifitas masih rendah
  4. Keterbatasan akses Akses modal
  5. Pengetahuan dan ketrampilan  pengelolaan agribisnis  peternakan terbatas